核酸是两性电解质，在一定pH条件下带有电荷，可用电泳或离子交换方法分离。
(一)核酸的紫外吸收
核酸分子的碱基含有共轭双键，在260nm波长处有最大紫外吸收，可以利用这一特性对核酸进行定量和纯度分析。
(二) DNA变性和复性
①DNA变性是指在某些因素作用下，DNA双链互补碱基之间的氢键发生断裂，DNA双螺旋分子被解开呈单链的现象。DNA变性的本质是互补碱基之间的氢键断裂而破坏DNA的二级结构，但不影响一级结构即碱基的排列顺序。引起DNA变形的因素有加热和化学物质的作用。
②DNA的变性是可逆的，热变性后温度缓慢下降时，解开的两条链可重新缔合形成双螺旋，这一过程称为DNA的复性。