(一)呼吸链的概念
酶和辅酶在线粒体内膜上按一定顺序排列组成的递氢或递电子体系称为呼吸链。
(二)两条呼吸链的组成和排列顺序：
1)组成和作用： 呼吸链主要成分有如下五类：
①辅酶I(尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸，NAD+)和辅酶II(尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸，NADP+)：NAD+作为许多不需氧脱氢酶的辅酶，将作用物的脱氢与呼吸链的传递氢过程联系起来，是递氢体。
②黄素酶或黄素蛋白(FP)：黄素酶种类很多，但辅基只有两种：黄素单核苷酸(FMN)和黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD)。FMN和FAD分子能可逆地进行加氢和脱氢反应，故也是递氢体，其分子中每次能接受两个氢原子。 。
③铁硫蛋白(Fe-S)：铁硫蛋白是一类在分子中含有非血红素铁和对酸不稳定的含硫蛋白质。铁硫蛋白种类较多，在线粒体内膜上往往与黄素酶或细胞色素结合成复合物存在。铁硫蛋白分子中所含的Fe-s构成活性中心，称为铁硫中心(Fe-S)，其中的铁能可逆地进行氧化还原反应，每次传递一个电子。
④辅酶Q(CoQ)：辅酶Q为一脂溶性醌类化合物，广泛存在于生物界，又名泛醌。其分子中的苯醌结构能可逆地进行加氢和脱氢反应，是递氢体。
⑤细胞色素(Cyt)：细胞色素是一类以铁卟啉为辅基的结合蛋白质，可分为a、b、c三大类，每类又有若干种。主要的细胞色素有a、a3、b、c和c1。它们共同的作用特点是作为电子传递体，其卟啉环中的铁离子进行可逆的氧化还原反应。细胞色素a与a3不易分开，统称为细胞色素aa3，亦称为细胞色素氧化酶。
2)呼吸链各成分的排列顺序
线粒体内参与氧化磷酸化的呼吸链主要有两条，即NADH氧化呼吸链和FADH2氧化呼吸链。这两条呼吸链的组成和排列顺序是：
NADH氧化呼吸链：NADH→FMN→CoQ→Cyt b→Cyt c1→Cyt c→Cyt aa3→O2
琥珀酸氧化呼吸链：琥珀酸→FAD→CoQ→Cyt b→Cyt c1→Cyt c→Cyt aa3→O2