近几年来，在PCR基础上完善和发展起来的多种基因变异检测方法是基因分析和检测的一次技术革命。其中日本学者创建的PCR-SSCP(Single-Strand Conformation Polymorphism anal-ysis of PCR products)格外重要。它是指单链DNA分子在变性PAGE中电泳迁移率随其构象的改变而改变的性质。单链DNA分子的构象改变即可由DNA多态性引起，又可由基因突变引起。为此，有的学者试图用PCR-SSGE(Single-Strand Gel Electrophoresis of PCR products)代替原命名。
PCR-SSCP分析包括PCR扩增和单链产物电泳两个阶段。对于分析小于400bp的PCR产物十分有效，对于大于400bp的PCR产物需处理后再分析，必须注意的是PCR-SSCP分析不能确定基因变异部位和内容，泳动后必须进一步完成DNA测序。