多肽链中氨基酸序列分析
a.分析纯化蛋白质的氨基酸残基组成
(蛋白质水解为个别氨基酸，测各氨基酸的量及在蛋白质中的百分组成)
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测定肽链头、尾的氨基酸残基
二硝基氟苯法(DNP法)
头端 尾端 羧肽酶A、B、C法等
丹酰氯法
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水解肽链，分别分析
胰凝乳蛋白酶(糜蛋白酶)法：水解芳香族氨基酸的羧基侧肽键
胰蛋白酶法：水解赖氨酸、精氨酸的羧基侧肽键
溴化脯法：水解蛋氨酸羧基侧的肽键
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Edman降解法测定各肽段的氨基酸顺序
(氨基末端氨基酸的游离α-氨基与异硫氰酸苯酯反应形成衍生物，用层析法鉴定氨基酸种类)
b.通过核酸推演氨基酸序列。