胆道手术，尤其是肝内胆管手术是腹部外科中比较复杂的手术。据全国71所医院4197例肝内胆管结石手术的统计，手术并发症的发生率为13.25%，多与胆道或全身化脓性感染有关。严重并发症中，休克占2.88%，败血症2.1%，急性胆管炎5.14%，肝脓肿0.59%，胆道出血1.39%，手术死亡率为1.88%.胆道手术并发症发生率高的原因有：
（1）胆管及肝动脉的各种变异情况较多，术中容易误伤。
（2）胆管结石易并发反复的胆道感染，后期所致的肝实质性损害如肝纤维化、肝萎缩、胆汁性肝硬变、门静脉高压症等，常使胆管手术在有肝功能严重损害或代偿不全的极不利的情况下进行，手术本身要冒双重的风险。
（3）结石引起的肝内胆管感染、肝胆管积脓、胆管源性肝脓肿等并发症，不仅增加手术的危险性，并常促使在紧急情况下施行急症手术。有的病人曾做过不同种类的胆道手术，使病情更为复杂化。
（4）因胆管结石长期发作，患者常有贫血、低蛋白症、营养不良等情况，对术后的恢复影响较大。
（5）胆结石并发黄疸时，可造成对肾脏的损害，导致术后并发急性肾衰。黄疸可使机体免疫功能下降，使感染的发生率增加。此外，黄疸使胃在应激状态下易发生急性胃粘膜损伤，导致应激性溃疡出血。