电镜下细胞凋亡的形态学变化是多阶段的，可分为①细胞浆浓缩，核糖体、线粒体等聚集，细胞体积缩小，结构更加紧密;②染色质逐渐凝聚成新月状附于核膜周边，嗜碱性增强。细胞核固缩呈均一的致密物，进而断裂为大小不一的片段：③胞膜不断出芽、脱落，细胞变成数个大小不等的由胞膜包裹的凋亡小体(apoptoticbodies)。凋亡小体内可含细胞浆、细胞器和核碎片，有的不含核碎片;④凋亡小体被具有吞噬功能的细胞如巨噬细胞、上皮细胞等吞噬、降解：⑤凋亡发生过程中，细胞膜保持完整，细胞内容物不释放出来，所以不引起炎症反应。