大多数HCC伴有乙型肝炎病毒（HBV）或丙型肝炎病毒（HCV）相关的慢性肝病。HCV感染是西方国家终末期肝病的首位原因，而HCC是HCV慢性感染病人的首位死亡原因。HCV肝硬化病人的HCC年发病率为3%～5%，常发生于有进展期纤维化或硬化者，提示HCV本身有直接致癌能力。Mohamed等指出，在埃及，13%的人口HCV阳性，如无任何干预措施，今后20年中，HCC的死亡率将增长3.5倍。Williams等发现，亚洲地区HBV、HCV合并HIV感染的发生率快速增长，特别是在东南亚地区。部分地区与黄曲霉素B1的摄入，过量饮酒或血色病等代谢性疾病有关。
针对这些病因，预防措施包括：①接种疫苗，避免感染。已证实HBV疫苗可降低HCC的发病率，HCC成为第一个可用疫苗预防的肿瘤。但迄今尚无HCV疫苗，主要通过避免接触可能污染的血液，防止HCV感染。②治疗慢性肝病。有效的抗病毒治疗可有效预防HCC，或者至少降低发病风险。应用干扰素（IFN）持久清除HCVRNA可降低HCC的发病率，但尚无充分证据证明出现肝硬化后抗病毒疗法或长期应用IFN可预防HCC.③降低黄曲霉素B1的摄入量。通过改善食品贮存条件等措施可有效降低黄曲霉素B1的摄入量。还可通过药物干预促进血液中黄曲霉素B1的清除。④加强血色病的筛查。应尽可能在其硬化前发现并予以及时治疗，避免进展为肝硬化和HCC.