放射治疗：术前放疗可提高手术切除率、保肛率，降低局部复发率；术后放疗仅适用于晚期或手术未达到根治的患者。
化疗：术前化疗（即新辅助化疗）可使肿瘤降期，提高手术切除率；辅助化疗能明显提高Ⅱ～Ⅲ期结、直肠癌5年生存率。方案均以5-Fu为基础用药，主要为FOLFOX方案：奥沙利铂、亚叶酸钙（CF）、5-Fu联合用药；XELOX方案：奥沙利铂+Xeloda的联合用药；MAY0方案：5-Fu和CF的配伍。
新辅助放化疗：术前放化疗能使肿瘤体积缩小，达到降期作用，从而提高手术切除率及降低局部复发率。
推荐在Ⅲ、Ⅳ期结直肠癌患者中应用辅助化疗、新辅助化疗；而在中低位、中晚期直肠癌建议新辅助放化疗，Ⅱ期患者也可从中获益，Ⅰ期结、直肠癌患者不建议使用辅助化疗。
其他治疗：靶向治疗、基因治疗、免疫治疗已显出良好的临床应用前景；低位直肠癌肠腔狭窄无法手术切除者，可用电灼、液氮冷冻、烧灼等局部治疗以改善症状。