门静脉高压症的病理生理特点如下：
（一）脾肿大、脾功能亢进
门静脉血流受阻后，首先发生脾脏充血肿大，脾窦的长期充血、脾内纤维组织增生和脾髓细胞增生引发不同程度的脾功能亢进。
（二）交通支扩张
临床上特别重要的是胃底、食管交通支显著扩张，于食管胃底粘膜下形成曲张静脉丛，使粘膜变薄，容易发生破裂引起致命性大出血。其他交通支亦可发生扩张，如脐旁静脉与腹上、下深静脉交通支扩张可引起腹壁浅静脉怒张；直肠上、下静脉丛扩张引起继发性痔。
（三）腹腔积液
门静脉高压肝功受损代偿不全时，出现低蛋白血症致血浆胶体渗透压降低及淋巴液生成增加；门静脉压升高，使毛细血管床滤过压升高。以上因素使液体从肝表面、肠浆膜面漏入腹腔。继发性醛固酮抗利尿激素分泌过多，致水钠潴留，加剧腹腔积液形成。
（四）门静脉高压性胃病
约20％患者合并本症。门脉高压时，胃壁淤血、水肿，胃粘膜下层的动-静脉交通支广泛开放，胃粘膜微循环发生障碍，导致胃粘膜防御屏障的破坏，形成本病。
（五）肝性脑病
门脉高压时由于自身门体血流短路或手术分流，造成大量门静脉血流绕过肝细胞；肝实质细胞功能严重受损，以上两因素致使有毒物质不能代谢与解毒而直接进入体循环，从而对脑产生毒性作用并出现精神神经综合征。