中、晚期贲门癌的影像诊断应与贲门失弛缓症、食管裂孔症、胃底静脉曲张、肝左叶阴影、贲门区平滑肌类肿瘤等疾病相鉴别。
（1）贲门失驰缓症 临床病程较长，症状时轻时重，X线表现主要为胃泡变小或消失，食管下端呈“鸟嘴状”狭窄，但食管下端及胃壁的边缘光整，粘膜整齐，钡剂通过困难，近端食管可能性明显扩张，甚至可使纵隔影增宽，在大量吞服钡剂或温水后，贲门可稍扩张；而贲门癌的病程较短，贲门病变的狭窄段边缘多不光整，粘膜破坏，管壁僵直，近端食管亦可呈扩张改变，若能同时发现肿瘤浸润食管下端及教`育网搜 集整理胃壁的X线征象，则更有助于鉴别。贲门驰缓症也可合并贲门癌，此时诊断比较困难。如在原有贲门失驰缓症的基础上出现病变部位边缘不规则、充盈缺损及粘膜破坏，应警惕贲门癌的可能。
（2）食管裂孔疝 由于疝囊通过裂孔处的缩窄以及胃粘膜上移造成粘膜不规则增粗，有时可被误诊为贲门癌。但前者管壁柔软、形态可变，后者管壁僵直伴粘膜破坏，且图像固定。明确诊断必须找到贲门口的位置，并依靠在透视下采取多种体位观察和改变腹腔压力进行鉴别。
（3）胃底静脉曲张 X线所见为贲门及胃底有颗粒状或息肉样充盈缺损，有时也可形成较大肿块状影，卧位时可见胃底边缘不规则，粘膜迂曲、增粗，范围可以较广泛，但胃壁柔软，往往同时并有食管下段静脉曲张的改变，临床上无吞咽困难症状；贲门癌的病变多局限在胃泡内侧，胃壁僵直，粘膜中断、破坏。结合病史以及食管的改变，可以帮助鉴别。
（4）肝左叶肿大 肝左叶的尖部位于胃底贲门区的前方。如肝左叶肿大，可能在胃底贲门区显示软组织肿块影，于正位和右前斜位时较明显，于右前斜位时往往可以与胃分开而消失；无钡剂在“肿块”上附着，贲门局部的粘膜皱襞正常。
（5）贲门区平滑肌类肿瘤 包括平滑肌瘤、平滑肌肉瘤及平滑肌母细胞瘤。它们的临床表现和X线表现很相似。肿瘤常为球形或半球形，可有分叶，边缘大多光滑规则。教`育网搜 集整理肿块表面的粘膜皱襞展平、消失，周围粘膜无破坏，肿块中央常伴有溃疡。病变附近胃壁柔软，周围正常粘膜皱襞可直接延续到肿块表面，如肿瘤以向腔外生长为主，则胃为受压移位改变，胃壁有局限性凹陷。CT及B超检查可较好地观察肿块向腔外生长的情况，有利于贲门癌鉴别。